Специфічні природно-кліматичні і соціально-економічні особливості Закарпатської області визначили  основні напрямки наукової діяльності установи:

• розробка і впровадження  контурно-меліоративної  системи  землеробства  та  ґрунтозахисних технологій вирощування  сільськогосподарських  культур;
• розробка технологій збереження та відновлення продуктивності деградованих природніх лук та пасовищ в гірській зоні Закарпаття;
• створення нових високопродуктивних  сортів  та  гібридів  кукурудзи, картоплі, тютюну, овочевих та пряно-ароматичних культур з  високою  якістю  врожаю, комплексностійких  до  захворювань  та  шкідників;
• збереження зразків генофонду кукурудзи, тютюну та зникаючих рідкісних сортів плодових і горіхоплідних культур;
• розробка та впровадження інтенсивних технологій в рослинництві,  кормовиробництві  та  тваринництві;
• сортовивчення та сортооновлення винограду, плодових та плодово-ягідних культур і розробка екологічно безпечних технологій вирощування зерняткових культур відповідно до зонального розміщення насаджень Закарпаття;
• розробка науково-обгрунтованих методів збереження, удосконалення та ефективного використання бурої карпатської породи великої рогатої худоби та коней гуцульської породи, їх помісей в господарствах різних форм власності Закарпатської області;
•  забезпечення  насіннєвих  господарств  насінням  еліти  зернових, , картоплі, тютюну та сортозаміни, багаторічних трав з метою своєчасного  сортооновлення  та  сортозміни;
• вивчення та  узагальнення досягнень вітчизняної  та  світової  науки  з питань землеробства, садівництва, виноградарства, тваринництва, економіки і т.д;
• консультація  сільськогосподарських   підприємств, селянських, фермерських  та  орендних  господарств;
• організація видання у встановленому  порядку  збірників  наукових праць, брошур, листівок, плакатів, а також  читання  лекцій,  проведення  симпозіумів, семінарів  та  інших  заходів  по  підвищенню  кваліфікації  спеціалістів  агропромислового    комплексу;
• надання маркетингових та консультативних послуг, розробка, впровадження науково-практичних, технічних досягнень, “ноу-хау”;
• надання рекламно-видавничих послуг, проведення виставок, ярмарок, аукціонів, інших подібних заходів.

Колектив  Закарпатської  державної сільськогосподарської   дослідної станції виконує науково-дослідні роботи, що входять  у програми  наукових досліджень, за такими напрямами:

• ПНД 02 «Системи землеробства і землекористування»
• ПНД 09 «Сталий розвиток Карпатського регіону в умовах реалізації євроінтеграційних пріоритетів»
• ПНД  17 «Генетичні ресурси рослин»;
• ПНД 20 «Овочівництво і баштанництво» ;
• ПНД 21 «Картоплярство» ; 
• ПНД 22 «(Плодове та декоративне садівництво» ;
• ПНД 23 «Розвиток виноградарства і виноробства» ;
• ПНД 25 «Кормовиробництво»; 
• ПНД 28 «Ефіроолійні, лікарські та пряно-ароматичні рослини» ;
• ПНД 31 «Генетика, збереження та відтворення біоресурсів у тваринництві» ;
• ПНД 36 «Аграрна економіка» ;
• ПНД 39 «Національна продовольча система» ;     
• ПНД 44 «Інноваційний розвиток».