Специфічні природно-кліматичні і соціально-економічні особливості Закарпатської області визначили основні напрямки наукової діяльності установи:
- розробка і впровадження контурно-меліоративної системи землеробства та ґрунтозахисних технологій вирощування сільськогосподарських культур;
- розробка технологій збереження та відновлення продуктивності деградованих природніх лук та пасовищ в гірській зоні Закарпаття;
- вивчення закономірностей динаміки показників основних агрохімічних властивостей ґрунтів та кругообігу ессенціальних мікроелементів і важких металів в системі ґрунт-рослина;
- створення нових високопродуктивних сортів та гібридів кукурудзи, картоплі, тютюну, овочевих та пряно-ароматичних культур з високою якістю врожаю, комплексностійких до захворювань та шкідників;
- збереження зразків генофонду кукурудзи, тютюну та зникаючих рідкісних сортів плодових і горіхоплідних культур;
- розробка та впровадження інтенсивних технологій в рослинництві, кормовиробництві та тваринництві;
- сортовивчення та сортооновлення винограду, плодових та плодово-ягідних культур і розробка екологічно безпечних технологій вирощування зерняткових культур відповідно до зонального розміщення насаджень Закарпаття;
- розробка науково-обгрунтованих методів збереження, удосконалення та ефективного використання бурої карпатської породи великої рогатої худоби та коней гуцульської породи, їх помісей в господарствах різних форм власності Закарпатської області;
- забезпечення насіннєвих господарств насінням еліти зернових, , картоплі, тютюну та сортозаміни, багаторічних трав з метою своєчасного сортооновлення та сортозміни;
- вивчення та узагальнення досягнень вітчизняної та світової науки з питань землеробства, садівництва, виноградарства, тваринництва, економіки і т.д;
- консультація сільськогосподарських підприємств, селянських, фермерських та орендних господарств;
- організація видання у встановленому порядку збірників наукових праць, брошур, листівок, плакатів, а також читання лекцій, проведення симпозіумів, семінарів та інших заходів по підвищенню кваліфікації спеціалістів агропромислового комплексу;
- надання маркетингових та консультативних послуг, розробка, впровадження науково-практичних, технічних досягнень, “ноу-хау”;
- надання рекламно-видавничих послуг, проведення виставок, ярмарок, аукціонів, інших подібних заходів.
Колектив Закарпатської державної сільськогосподарської дослідної станції виконує науково-дослідні роботи, що входять у програми наукових досліджень, за такими напрямами:
- ПНД 01 «Грунтові ресурси: прогноз розвитку, збалансоване використання та управління» ;
- ПНД 02 «Новітні системи землеробства і землекористування»;
- ПНД 17 «Картоплярство» ;
- ПНД 18 «Овочівництво і баштанництво» ;
- ПНД 19 «Плодівництво та ягідництво» ;
- ПНД 21 «Виноградарство і виноробство» ;
- ПНД 22 «Корми і кормовий білок»;
- ПНД 24 «Генофонд рослин»;
- ПНД 26 «Ефіроолійні, ароматичні та лікарські рослини» ;
- ПНД 31 «Птахівництво»;
- ПНД 32 « Вівчарство» ;
- ПНД 37 «Збереження генофонду тварин» ;
- ПНД 40 «Аграрна економіка» ;
- ПНД 42 «Харчова і переробна промисловість» ;
- ПНД 44 «Інноваційний розвиток».